Le Rotary est organisé en clubs et districts.

Il comporte aussi une Administration centrale (à Evanston, Illinois, Etats-Unis) et régionale (sept bureaux situés en Argentine, Australie, Brésil, Corée, Inde, Japon et Suisse). La Grande-Bretagne et l'Irlande ont un statut particulier et disposent d'un bureau à Alcester (Angleterre).

Les dirigeants du Rotary International sont

• le Conseil d'administration.
  Ses 19 membres (17 directeurs, le président international et le président international élu) se réunissent chaque trimestre pour adopter directives et fixer la politique de l’organisation. Traditionnellement, le président du Rotary, élu pour un mandat d’un an, choisit un thème et des domaines d’action prioritaires ;
• le secrétaire général ;
• les gouverneurs de district ; ainsi que
• le président, le président sortant, le vice-président et le trésorier du RIBI (Grande-Bretagne et l'Irlande).

Ils représentent le Rotary International et non des intérêts nationaux. Ils sont nommés et élus conformément au règlement intérieur du Rotary.

Quartier général du Rotary International à Evanston

Si le président international est le plus haut responsable du Rotary International, le chef administratif du Rotary International est le secrétaire général. Il dirige une équipe de 650 personnes qui travaillent au quartier général du Rotary International basé dans la banlieue de Chicago (Etats-Unis) à Evanston ou dans un des bureaux régionaux répartis dans le monde.

Le siège du Rotary International, en association avec les bureaux régionaux et le bureau pour la Grande Bretagne et l'Irlande, couvre les besoins administratifs, reçoit les cotisations et les rapports, alloue les aides financières et compile les statistiques. Ce sont ces bureaux qui assurent aussi la communication et l'information au sein du Rotary avec un site Web, la publication de revues régionales, la réalisation de vidéos et de documentation en tout genre.

Le Rotarien est membre de son Rotary club. Le Rotary club est membre de l'association appelée Rotary International. Chaque club choisit des dirigeants et jouit d’une assez grande autonomie circonscrite cependant par les statuts et le règlement intérieur du Rotary.